今回導入したクラスタリング・サーバーは、産学分野向けにHPC(ハイパフォーマンスコンピューティング)システムなどを納入しているビジュアルテクノロジー株式会社が開発したもので、AMD Opteronプロセッサモデル244を搭載し、 OSにはTurbolinux 8 for AMD64が採用され、フル64bit環境を実現しました。当初は64プロセッサを搭載、その後順次拡張し、最終的には512プロセッサを目指しています。
同志社大学では、この高速演算クラスタリング・サーバーを、バイオインフォマティクス分野で注目が集まっているタンパク質の構造解析や、大気汚染の軽減に役立つディーゼルエンジンの最適燃料噴射デザインなどに使用します。

Turbolinux 8 for AMD64は、AMD64アーキテクチャ専用のOSとして2003年5月16日より出荷開始した、日本で最初のLinux OS製品です。 32ビットアプリケーションも制限なく実行可能という互換性のメリットをOSレベルでも実現し、よりシームレスに32ビット環境から64ビット環境への移行を行うことが可能です。 32ビットアプリケーション資産を活用しながら、64ビット・コンピューティングの拡張性を享受することができるため、大幅なコスト削減を実現します。

ビジュアルテクノロジーによる、64プロセッサシステムでのLINPACK(*1)ベンチマークテストでは、Turbolinux 8 for AMD64に標準でパッケージされているGNUコンパイラを使用しGigabit Ethernetネットワーク接続にて148.7GFLOPS (マトリックスサイズ85000)の結果を得ており、512プロセッサシステムを高速LANで接続した場合では1TFLOPS（浮動小数点演算を1秒間に1兆回実行）を超える性能を得ることが予想できると発表しています。

同志社大学 工学博士 三木光範教授(同志社大学大学院工学研究科)コメント
「AMD Opteronプロセッサを選択した最大の理由は、ハイエンド・クラスタ・コンピューティング環境を作り上げるためのコスト・パフォーマンスが極めて高いことです。 現在、クラスタ・コンピューティングにおいては32ビットのプロセッサが主流ですが、HPCに要求されるメモリ空間の大きさと高度な演算性能を持つ64ビット・プロセッサがこれからの中心となることは間違いありません。
特に、AMD Opteronプロセッサでは、独特のHyperTransportTMベースのチャネルを利用して、オンボードでのマルチプロセッサ・システムが簡単に構築でき、 しかも極めて高いプロセッサ間通信性能を発揮します。また、32ビット環境からOSや既存プログラム資産をスムーズに移行させることのできるAMD Opteronプロセッサは、 そうした現有資産や現有技術を活用しながら新しい時代に乗り換えるという観点から、最適のプロセッサだと思っています。」

日本AMD株式会社 代表取締役社長　堺 和夫氏コメント
「AMD Opteronプロセッサは、クラスタ環境で使用されるモデリング/設計アプリケーションなど、HPC分野の用途に適しています。この度、その高性能と信頼性が認められ、日本を代表する高等教育機関の一校である同志社大学での採用が決まったことを、 たいへん光栄に思います。AMDは今後も、お客様のご要望に耳を傾け、期待に違わないソリューションを提供してまいります」

ビジュアルテクノロジー株式会社　代表取締役会長兼社長　川股要一氏コメント
64bitプロセッサであるAMD Opteronを搭載したクラスタシステムは、その大きなメモリバンド幅などの特徴から、特に大規模な科学技術分野の数値計算に対して優れた適合性を持つシステムであるといえます。 また、AMD Opteronプロセッサは、既存32ビット・アプリケーションに対する互換性を保ちつつ、64ビットへの拡張を保持することが出来るように設計されているため、 HPCユーザーにとって真に最適な環境といえます。さらにコスト・パフォーマンスの観点から見ても、既存64ビット・システムに対して極めて大きな優位性を持っています。 AMD Opteronベースのシステムは、今後のHPC分野におけるフラッグシップとなり得ると確信しています」

*1:LINPACK
LINPACKは、米国のテネシー大学のJ.Dongarra博士によって開発されたプログラムで、LU分解および前進代入、後退代入を含んだ連立一字方程式の解法ライブラリーです。本来ベンチマークのために作成されたものでないが、LINPACKによるベンチマーク結果が、スーパーコンピュータからワークステーション、パーソナルコンピュータに至るまで数多く蓄積されてきたことで、ベンチマーク・ プログラムとしての地位を獲得しています。スーパーコンピュータランキング「TOP500」(http://www.top500.org/)ではLINPACKベンチマークテスト結果をランキングの対象にしています。